NovaDock
由于其复杂性，准确模拟蛋白质-蛋白质对接相互作用通常非常具有挑战性。NovaDock分子对接软件能够利用SwarmDock预测任何两个结合伙伴的蛋白质-蛋白质对接相互作用，SwarmDock是在CAPRI盲对接实验中验证的顶级算法之一。利用 SwarmDock 算法，NovaDock 探索了对接时蛋白质的灵活性，从而实现更准确的预测。只需提供您的配体和受体PDB或结构文件，如果需要，建议结合伴侣之间的特定残基接触。然后，NovaDock 将预测大分子复合物的三维结构，并为每个模型提供能量评分、簇大小和配体接触数量，以便在 Protean 3D 中进行分析。
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资源
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常见问题
我是否需要Lasergene许可证才能运行NovaDock分子对接软件？
是的。运行 NovaDock 需要 Lasergene Protein 许可证。Lasergene Protein 中包含的 Protean 3D 提供了运行 NovaDock 预测和分析结果的接口。
你们提供 NovaDock 的免费试用吗？
我们的Lasergene免费试用版中包含对每个Nova应用的一个预测。我们还提供免费的、无义务的、个性化的演示，由我们的一位科学家根据您的特定研究目标量身定制。
NovaDock 使用什么预测方法？
NovaDock的算法基于SwarmDock，由英国癌症研究中心伦敦研究所的Paul Bates博士实验室开发，并在Francis Crick研究所进行。NovaDock 不使用模板库，而是根据一种称为“粒子群优化”的能量计算进行对接预测。