NovaFold AI & NovaFold AI-Multime
计算生物学在过去几年中取得了长足的进步，DNASTAR在商业蛋白质结构预测方面处于领先地位。预测和分析都在Protean 3D的现有NovaCloud服务界面中进行。
NovaFold AI 甚至可以处理最困难的单链折叠问题
我们的 NovaFold AI 蛋白质结构预测软件使您能够无缝地利用屡获殊荣的 AlphaFold 2 方法来预测氨基酸序列的蛋白质结构，然后可视化和分析您的结果。AlphaFold 2 是 2020 年 CASP14 挑战赛中排名第一的蛋白质结构预测方法，通过确定蛋白质结构，其精度可与实验室实验相媲美，明显优于其他参赛团队。在最近的 CASP 挑战赛中，AlphaFold 2 在 92 个目标上取得了 2.65 的平均 Z 分数。最接近的竞争对手在相同数量的目标下仅获得了 1.00。（见图）。AlphaFold 2 速度极快，通常在几个小时或更短的时间内完成结构预测。
NovaFold AI 是第一款能够准确预测最具挑战性的蛋白质结构的商业软件：
• 膜结合蛋白
• 融合蛋白
• 胞质结构域 （CD）
• 细胞外区域
• G 蛋白偶联受体 （GPCR）
NovaFold AI 还可以对多个结构域及其与接头的相互作用进行建模，也称为多结构域蛋白质结构预测。
NovaFold AI-Multimer 用于准确预测多链蛋白质复合物
NovaFold AI-Multimer 使用 AlphaFold-Multimer 算法，这是 AlphaFold 2 的扩展，由 DeepMind 构建，用于预测多链蛋白质复合物，也称为“多聚体”。与 AlphaFold 2 相比，AlphaFold-Multimer 使用两个额外的指标来评估预测准确性。与 NovaFold AI 简化 AlphaFold 2 流程的方式类似，NovaFold AI-Multimer 增强了使用 AlphaFold-Multimer 设置和运行预测的便利性。使用标准 Windows 或 Mac 计算机设置预测只需一两分钟。
AlphaFold-Multimer 尚未以自己的名义进入 CASP。然而，CASP15 （2022） 多聚体靶标类别中表现最好的三个，这是计算结果的最新实验，将该算法用作其方法的基础要素。因此，AlphaFold-Multimer被广泛认为是迄今为止预测蛋白质-蛋白质复合物四级结构的最准确的算法。
了解有关 NovaFold AI 和 NovaFold AI-Multimer 的更多信息
资源
有关NovaFold蛋白质结构预测软件的更多信息，请参阅下面的资源。
常见问题
我是否需要Lasergene许可证才能运行NovaFold AI蛋白质结构预测软件？
是的。运行 NovaFold AI 或 NovaFold AI-Multimer 需要 Lasergene Protein 许可证。Lasergene Protein 中包含的 Protean 3D 提供了用于运行预测和分析结果的接口。
你们提供 NovaFold AI 的免费试用吗？
我们的Lasergene免费试用版中包含对每个Nova应用的一个预测。我们还提供免费的、无义务的、个性化的演示，由我们的一位科学家根据您的特定研究目标量身定制。
NovaFold AI 使用什么蛋白质折叠预测方法？
NovaFold AI 使用 DeepMind 开发的 AlphaFold 2 人工智能算法。在最近的 CASP 挑战赛中测试的 140 多种预测算法中，AlphaFold 2 不仅是最准确的，而且比次优算法的准确率高出惊人的 2.65 倍。AlphaFold 2 使用基于其 ~100,000 个蛋白质结构的训练数据的图形神经网络创建残基之间的距离图。其预测过程的一部分是与包含的库中的现有模板进行比较。与使用 I-TASSER 算法的 NovaFold 不同，NovaFold AI 不直接使用模板来放置原子坐标。但是，NovaFold AI 确实使用模板作为地图构建过程的一部分。
NovaFold AI-Multimer使用什么蛋白质折叠预测方法？
NovaFold AI-Multimer 使用 DeepMind 开发的 AlphaFold-Multimer 人工智能算法作为其 AlphaFold2 算法的扩展。它经过优化，可以预测多链蛋白质复合物，也称为“多聚体”。AlphaFold-Multimer 于 2021 年推出，比 AlphaFold2 晚一年。