MegAlign Pro

MegAlign Pro 提供完整的序列比对软件包，包括比对每个阶段所需的一切——不仅包括比对基因水平和基因组规模序列数据所需的算法 ，还包括在比对后阶段深入​​挖掘的能力。

MegAlign Pro 可以快速轻松地执行多重和成对序列比对，然后指导您完成比对后过程，让您生成系统发育树、评估变体、分离有趣的区域以进​​行新的子比对、编辑和修剪单个序列或整个比对，并在生成适合发布的高质量图像之前自定义比对的外观。

了解有关MegAlign Pro 的更多信息

工作流程 |资源 |常见问题解答 |比较套餐

MegAlign Pro 工作流程

资源

请参阅下面的资源以获取有关 MegAlign Pro 序列比对软件的更多信息。

常见问题解答

哪个 Lasergene 套件包含 MegAlign Pro？

MegAlign Pro 包含在Lasergene Molecular Biology  以及完整的DNASTAR Lasergene 包中，该包包含Lasergene Molecular Biology、 Lasergene Protein和Lasergene Genomics的所有应用程序。

MegAlign Pro 中提供哪些多序列比对方法？

MegAlign Pro 序列比对软件包括 Clustal Omega、Clustal W、MAFFT 和 MUSCLE 算法，用于比对 DNA 和蛋白质序列。

我可以在 MegAlign Pro 中修改我的多序列比对吗？

是的。MegAlign Pro 支持多种方式修改对齐。您可以：

• 重新对齐现有的对齐序列以及选定的未对齐序列
• 修剪位于对齐的开始或结束处的末端。
• 使用不同的参数或不同的比对引擎重新比对一系列比对序列。
• 将两个现有的已完成对齐合并在一起。
• 将“未对齐序列”区域中的所有/选定的序列添加到当前对齐中，同时保留原始合并前对齐的所有间隙。
• 重新对齐现有的对齐序列以及选定的未对齐序列

MegAlign Pro 提供哪些方法来计算系统发育？

MegAlign Pro 提供两种生成系统发育树的方法：RAxML（用于计算机最大似然树）和邻接方法（使用 BIONJ 算法）。

我怎样才能评估我的比对中的变体？

MegAlign Pro 为病毒、线粒体和叶绿体基因组提供了广泛的变异分析功能。要分析变异，首先指定一个参考序列，可以是比对之前或之后。然后选择变异 > 计算变异。您可以在变异视图中分析和评估比对中变异的详细信息，包括位置、特征、影响和翻译变化。

显示较少

MegAlign Pro 提供哪些成对对齐方法以及我如何知道该使用哪一种？

MegAlign Pro 具有三种成对序列比对工具：

• 局部成对比对专门用于查找两个序列中得分最高的比对片段，即使这两个序列的全部范围未包含在最终比对中。
• 全局成对比对不会尝试找到得分最高的片段，而是要求将两个序列的全部范围都包含在其结果中。不要求或保证局部比对中得分最高的比对片段对将在全局比对中进行比对。
• 半全局成对比对是一种相对较新的方法，尤其适用于两个序列长度相差很大的情况。当发生这种情况时，较长的序列将在比对的两端有突出部分。由于突出部分以间隙表示，全局比对器将尝试通过将较短序列的部分与突出序列区域比对来提高匹配分数并最小化累积间隙惩罚。这种效果会产生许多不切实际的、通常很小的比对片段，这些片段在比对的末端附近被间隙隔开。半全局比对旨在通过不对突出部分中的间隙（又称“末端间隙”）进行惩罚来解决此问题。

比较 DNASTAR Lasergene 包

				DNASTAR Lasergene
	Lasergene分子生物学	Lasergene Genomics	Lasergene Protein
包含的应用程序				√
SeqBuilder Pro	√			√
SeqMan Ultra	√	√		√
MegAlign Pro	√			√
GeneQuest	√			√
GenVision	√			√
SeqNinja	√			√
SeqMan NGen		√		√
ArrayStar		√		√
GenVision Pro		√		√
Protean 3D （每个 Nova 应用程序 +1 个预测）			√	√
DNASTAR Navigator	√	√	√	√
支持的工作流
抗体噬菌体展示	√			√
自动虚拟克隆	√			√
克隆序列验证	√			√
凝胶电泳模拟	√			√
淡紫色基因组比对	√			√
多序列比对	√			√
成对序列比对	√			√
PCR引物设计	√			√
PCR定点诱变	√			√
系统发育分析	√			√
质粒图谱	√			√
序列编辑和注释	√			√
Sanger 序列组件	√	√		√
ChIP-Seq 数据分析		√		√
临床研究		√		√
De Novo转录组组装		√		√
大规模变异分析		√		√
宏基因组组装		√		√
NGS 从头基因组组装		√		√
RNA-Seq比对		√		√
病毒基因组分析		√		√
全外显子组/基因组测序		√		√
抗体建模			√	√
表位预测			√	√
蛋白质对接			√	√
蛋白质序列分析			√	√
蛋白质稳定性预测			√	√
蛋白质结构比对			√	√
蛋白质结构分析			√	√
蛋白质结构预测			√	√
与集成
DNASTAR云数据驱动器		√		√
DNASTAR 云组件		√		√
NovaDock			√	√
NovaFold			√	√
NovaFold AI			√	√
NovaFold 抗体			√	√
	查看定价	查看定价	查看定价	查看定价