NovaFold
确定蛋白质的 3D 结构对于理解其功能很重要,但在实验室中通过 X 射线晶体学进行此操作既昂贵又繁琐,尤其是在涉及大量蛋白质序列时。这就是我们开发蛋白质结构预测软件NovaFold的原因。NovaFold 利用了由密歇根大学Yang Zhang教授实验室开发的国际屡获殊荣的 I-TASSER 算法,该算法结合了combine threading和 ab initio 折叠技术,以构建具有以前未知结构的蛋白质的准确、完整的 3D 原子模型。在 Protean 3D 中查看和操作每个预测结构的模型,您可以在其中轻松分析结构数据、预测的结合位点和蛋白质功能。
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资源
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常见问题
我是否需要Lasergene许可证才能运行NovaFold蛋白质结构预测软件?
是的。运行 NovaFold 需要 Lasergene Protein 许可证。Lasergene Protein 中包含的 Protean 3D 提供了运行 NovaFold 预测和分析结果的接口。
你们提供 NovaFold 的免费试用吗?
我们的Lasergene免费试用版中包含对每个Nova应用的一个预测。我们还提供免费的、无义务的、个性化的演示,由我们的一位科学家根据您的特定研究目标量身定制。
NovaFold使用什么蛋白质折叠预测方法?
NovaFold 使用密歇根大学计算医学与生物信息学系的 Yang Zhang 教授开发的 I-TASSER 算法。这种蛋白质结构预测算法利用线程和从头开始折叠的组合来预测蛋白质结构。
线程尝试将查询序列的某些部分与模板序列进行匹配。模板序列及其实验求解的结构是 RCSB 蛋白质数据库 (PDB) 的一部分。从头折叠使用查询序列的生物物理特性和模拟来确定蛋白质的可能结构。