NovaFold Antibody
创建准确的抗体模型对于抗体设计和优化至关重要。虽然许多抗体建模软件工具仅依赖于同源性建模，但 NovaFold Antibody 的独特算法通过结合框架区域的同源性建模和基于片段或超变环区的从头建模来生成抗体和抗体片段的模型，从而实现高度准确的抗体结构预测.只需提供轻链、重链或两者的序列，NovaFold Antibody 将返回一份带注释的报告，其中包括预测的抗体模型，以及最有可能的重链和轻链模板以及 CDR 环位置的注释。在 Lasergene Protein 的 Protean 3D 中，通过注释轻松查看抗体建模结果，这允许您完全自定义渲染以帮助可视化，或准备要导出的出版质量图像。NovaFold Antibody 的抗体建模也可以与 NovaDock 结合使用，以预测抗体-抗原复合物的结构和结合。
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资源
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常见问题
我需要Lasergene许可证才能运行NovaFold Antibody吗？
是的。在NovaFold Antibody中生成抗体模型需要Lasergene Protein许可证。Lasergene Protein 中包含的 Protean 3D 为运行 NovaFold 抗体预测和分析结果提供了接口。
你们提供 NovaFold Antibody 的免费试用版吗？
我们的Lasergene免费试用版中包含对每个Nova应用的一个预测。我们还提供免费的、无义务的、个性化的演示，由我们的一位科学家根据您的特定研究目标量身定制。
抗体建模所需的轻链和重链序列支持哪些文件类型？
轻链和重链序列可以添加为以下蛋白质文件格式：.aa、.fap、.fas、.fasta、.gp、.gbk、.sbd、.pro。
NovaFold Antibody用于抗体建模的预测方法是什么？
NovaFold Antibody 算法结合了同源性建模和从头开始的环路预测，从而实现了高度准确的预测。在建模过程中，NovaFold Antibody 会针对来自 PDB 的数千个非冗余蛋白抗体结构搜索输入序列，并找到链或复合物的最佳模板匹配。
在建模过程中，NovaFold Antibody 特别考虑了互补决定区 （CDR） 环，即抗体中与抗原发生主要反应的高变区。重链上的三个 CDR 环称为 H1、H2 和 H3，而轻链上的三个环是 L1、L2 和 L3。H3通常是抗原结合中最重要的区域。由于其长度和灵活性的增加，它也是最难建模的。因此，NovaFold Antibody 将 H3 环建模限制为 15 个或更少的残基，这是抗体建模问题中常见的长度。最后，NovaFold Antibody 进行能量最小化计算，以构建抗体链或复合物的最终预测结构模型。在标准工作站计算机上，整个过程大约需要 5-15 分钟。